环境保护措施评价的主要内容有()。A. 审查环境影响报告书B. 审查治理方案C. 总投资是否包括环保工程费用;总设计是否坚持“三同时”原则D. 分析环境保护的经济性E. 审查技术方案

B选项，明确评价重点和环境保护目标属于环境影响评价第一阶段的工作；D选项，提出环境保护措施，进行技术经济论证属于环境影响评价第三阶段的工作。

根据《环境影响评价技术导则 生态影响》，生态环境保护措施基本内容包括：①生态保护措施应包括保护对象和目标，内容、规模及工艺，实施空间和时序，保障措施和预期效果分析，绘制生态保护措施平面布置示意图和典型措施设施工艺图。估算或概算环境保护投资。②对可能具有重大、敏感生态影响的建设项目，区域、流域开发项目，应提出长期的生态监测计划、科技支撑方案，明确监测因子、方法、频次等。③明确施工期和运营期管理原则与技术要求。可提出环境保护工程分标与招投标原则，施工期工程环境监理，环境保护阶段验收和总体验收，环境影响后评价等环保管理技术方案。

根据《环境影响评价技术导则—生态影响》，对可能具有重大、敏感生态影响的建设项目，区域、流域开发项目，应提出长期的生态监测计划、科技支撑方案明确监测因子、方法、频次等。