特别行政区的行政长官任期是五年。

考查特别行政区行政长官的当选条件和职责。根据《香港特别行政区基本法》第43条第2款的规定，香港特别行政区行政长官依照本法的规定对中央人民政府和香港特别行政区负责。根据第44条的规定，香港特别行政区行政长官由年满40周岁，在香港地区通常居住连续20年并在外国无居留权的香港特别行政区永久性居民中的中国公民担任。根据《澳门特别行政区基本法》第45条第2款的规定，澳门地区行政长官依照本法规定对中央人民政府和澳门负责。根据第46条的规定，澳门特别行政区行政长官由年满40周岁，在澳门通常居住连续20年的澳门特别行政区永久性公民中的中国公民担任。因此，B选项错误，澳门特别行政区的行政长官任职条件中并无在外国无居留权一项。

。考查特别行政区制度。

行政长官是特别行政区的首长，代表特别行政区，对中央人民政府和特别行政区负责。作为特别行政区的首长，对立法会负责。行政长官通过选举或者协商产生，由中央人民政府任命。任期五年，可连任一次。特别行政区行政机关的主要官员由行政长官提名报中央人民政府任命，所以，B选项错误，特别行政区行政机关的主要官员应当由中央人民政府任命。A、C、D选项正确。

。澳门行政长官在当地通过选举或协商产生，由中央人民政府任命。